Diagnóstico de tuberculosis: estudio comparativo de baciloscopia y GeneXpert frente a cultivo microbiológico. Hospital de Clínicas 2020-2022 Montevideo, Uruguay

Abstract

Introducción: La tuberculosis (TB) es una de las enfermedades infectocontagiosas más importantes a nivel mundial. En Uruguay, en el año 2022 la tasa de incidencia fue de 31,7/100.000 habitantes, lo que representa una incidencia media-alta a nivel regional, con una letalidad del 11 %. Uruguay cuenta con un programa de descentralización diagnóstica de la TB, con el objetivo de acelerar los tiempos diagnósticos, el cual se desarrolla a través de una Red Nacional de Laboratorios para el Diagnóstico de Tuberculosis (RNLDT) donde cada prestador de salud integrante de la Red, incluido el Hospital de Clínicas Dr. Manuel Quintela (HC), realiza estudios diagnósticos de TB a través de baciloscopia y/o técnicas moleculares (GeneXpert MTB/RIF Ultra) y el Laboratorio Nacional de Referencia (LNR) de la Comisión Honoraria para la Lucha Antituberculosa y Enfermedades Prevalentes (CHLA-EP), realiza el cultivo (técnica gold standard), la identificación y las pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos de las muestras derivadas. Objetivo: Comparar el rendimiento diagnóstico de la baciloscopia realizada en el HC y el rendimiento del GeneXpert MTB/RIF Ultra (GX), realizado en ambos laboratorios, con respecto al cultivo bacteriológico realizado en el LNR de la CHLA-EP. Materiales y métodos: Se realizó un estudio observacional descriptivo y retrospectivo, comparando las tres pruebas diagnósticas mencionadas mediante la utilización de la base de datos anonimizada extraída del laboratorio de microbiología del HC, entre los años 2020 y 2022, con diagnóstico presuntivo de TB, a los cuales se les realizó baciloscopia y/o GX y cultivo. Resultados: Se obtuvieron un total de 1136 muestras pertenecientes a 906 usuarios del HC. La baciloscopia obtuvo una sensibilidad global de 67,13 % (IC 95 %: 59,07-74,3) y una especificidad de 98,99 % (IC 95 %: 98,15-99,45), mientras que el GX obtuvo una sensibilidad global de 90,91 % (IC 95 %: 78,84-96,41) y una especificidad de 92,84 % (IC 95 %: 90,25-94,79). La incidencia de TB en el HC en el año 2020 fue de 0,14, 0,16 en el 2021 y 0,17 en el 2022. Conclusiones: La baciloscopia sigue siendo una técnica microbiológica, vigente, con buen rendimiento para el diagnóstico de TB en el HC, sobre todo en muestras pulmonares. La incidencia de TB no mostró aumentos significativos en el período 2020-2022.

Introduction: Tuberculosis (TB) is one of the main communicable diseases worldwide. During the year 2022, in Uruguay, the incidence was 31.7/100,000 individuals, which represents a medium-high incidence at a regional level and a case fatality rate of 11%. Uruguay has a plan for decentralizing the diagnosis of TB with the objective of reducing diagnostic delays, developed through the National Laboratory Network for the Diagnosis of Tuberculosis (RNLDT), integrated, among others, by the Hospital de Clínicas Dr. Manuel Quintela (HC) and the National Reference Laboratory (LNR) of the Honorary Commission for the Fight Against Tuberculosis and Prevalent Diseases (CHLA-EP). The samples are analyzed through an Acid-Fast Bacillus Smear Microscopy (AFB Smear Microscopy) and/or molecular techniques (GeneXpert MTB/RIF Ultra) by each health provider, including HC, while LNR performs the culture (gold standard technique), identification, and antimicrobial susceptibility tests. Objective: To compare the diagnostic performance of AFB Smear Microscopies at HC and the performance of GeneXpert MTB/RIF Ultra (GX) at both HC and LNR with the bacteriological cultures conducted by LNR. Materials and methods: A descriptive, retrospective observational study was performed, which included all patients from HC between 2020 and 2022 with a presumptive diagnosis of TB, and were subjected to an AFB Smear Microscopy and/or GX, and a culture. The study compared the three diagnostic tests mentioned, through the use of an anonymized database obtained from the HC microbiology lab. Results: There were a total of 1136 samples corresponding to 906 HC users between 2020 and 2022. The AFB Smear Microscopy had a global sensitivity of 67.13% (CI 95%: 59.09-74.3) and a specificity of 98.99% (CI 98.15-99.45), while the GX had a global sensitivity of 90.91% (CI 95 %: 78.84-96.41) and a specificity of 92.84% (IC 95%: 90.25-94.79). The incidence of TB in HC during 2020 was 0.14, 0.16 in 2021 and 0.17 in 2022. Conclusions: The AFB Smear Microscopy is still a valid method with an accurate performance for diagnosing TB, performing even better on pulmonary samples. There were no significant increases in incidence of TB during the 2020-2022 period.