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https://hdl.handle.net/20.500.12008/42586
Cómo citar
Carreras: | Licenciatura en Bioquímica Licenciatura en Ciencias Biológicas |
Código de la carrera: | 302 137 |
Tipo de la carrera: | Grado |
Unidad Curricular (Programa): | Programa de Transcriptómica 2: single-cell RNA-seq |
Código del programa: | BG992_2023 |
Año desde que se dicta: | 2023 |
Fecha de publicación: | 2023 |
Código del plan: | 1083 1110 |
Código de unidad curricular (curso): | BG992 |
Objetivos del curso: | El curso propone brindar al estudiante el entendimiento de los conceptos principales y de las aplicaciones de la transcriptómica de célula única, focalizado en el análisis de datos. Los conceptos incluyen: diferentes tecnologías de single-cell RNA-seq; aplicaciones; selección de muestras y replicación; pre-procesamiento de datos y control de calidad; reducción de dimensiones y clusterización; obtención de marcadores celulares e identificación de tipos celulares; análisis de expresión diferencial entre condiciones o grupos; interpretación de los resultados con respecto al rol de los genes en procesos y vías metabólicas; inferencia de interacciones célula-célula. Las herramientas incluyen: las de alineamiento y obtención de tablas de conteo (e.g. STAR-solo, Cell Ranger); pipeline de análisis de Seurat y múltiples paquetes de R y Python complementarios. El estudiante adquirirá habilidades que le permitirán: - diseñar un experimento de single-cell RNA-seq - analizar un experimento de single-cell RNA-seq - visualizar resultados a través de diferentes tipos de gráficos y comunicar efectivamente sus
resultados - pensamiento crítico: desarrollar la capacidad de evaluar e interpretar resultados transcriptómicos, así como hacer frente a problemas que puedan surgir. |
Responsable: | Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Comisión de Carrera Bioquímica Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Comisión de Carrera Ciencias Biológicas |
Licencia: | Licencia Creative Commons Atribución - No Comercial - Sin Derivadas (CC - By-NC-ND 4.0) |
Tipo: | Programa |
Cita: | Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Comisión de Carrera Bioquímica, Ciencias Biológicas. Programa de Transcriptómica 2: single-cell RNA-seq [en linea] 2023. Plan 2017, Plan 2017. |
Aparece en las colecciones: | Unidad Curricular (Programas) - Facultad de Ciencias |
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