Detección y caracterización molecular del virus de diarrea viral bovina en ganado bovino de nuestro país

Abstract

El virus de diarrea viral bovina (vDVB) es responsable de diversos problemas productivos y reproductivos en el ganado bovino, lo que lleva a grandes pérdidas económicas en el mundo. El virus está clasificado en la familia Flaviviridae, género Pestivirus, presentando dos especies vDVB-1 y vDVB-2 y una enorme diversidad genética asociada a los mecanismos de mutación y recombinación. En el año 2004 se identificó en suero fetal bovino, proveniente de Brasil, un nuevo virus (cepa D32/00_HoBi) que luego fue propuesto como genotipo 3 de vDVB. Para este estudio se procesaron 153 muestras de suero sanguíneo (n=153) pertenecientes a novillos y vaquillonas para carne y leche positivas a vDVB por la prueba de Elisa Antígeno. Los sueros fueron obtenidos del Banco de Sueros de la División de Laboratorios Veterinarios (DILAVE), del Ministerio de Ganadería Agricultura y Pesca. De ellos se utilizaron los que resultaron fuertemente positivos (n=60) para la detección molecular. Para la amplificación genómica se utilizaron dos pares de cebadores que hibridan en la región 5’ UTR: 324- 326 para la detección de los vDVB-1 y vDVB-2 y N2- R5 específico para la detección de los virus tipo Ho-Bi. Se obtuvieron 42 secuencias de buena calidad para el análisis filogenético, de las cuales 40 cepas (95,2 %) se agruparon como vDVB-1 y las otras dos como vDVB-2 (4,8 %). Dentro del vDVB-1, 36 cepas (90 %) se caracterizaron como subtipo 1a (aLRT=0,90) y las otras 4 (10 %) corresponden al subtipo 1i (aLRT=0,82 y aLRT=0,77). Dentro del vDVB-2, las dos secuencias agruparon en el subtipo 2b (aLRT=0,99). Se concluye que el vDVB-1 presenta mayor distribución en el país, en particular el subtipo 1a. Se detectaron cepas del subtipo 1i las que hasta el momento solo han sido descritas para América en Brasil y Uruguay. No se detectó la circulación de los virus tipo Ho-Bi. A futuro sería necesario ampliar la región a secuenciar con el fin de obtener mayor número de sitios informativos y mejorar la resolución de la filogenia y por ende la precisión de la genotipificación. El presente estudio, por el número elevado de muestras analizadas, los resultados obtenidos y su relación con las cepas de la región, constituye un aporte significativo al conocimiento de las cepas circulantes en el ganado bovino de nuestro país y a los estudios de epidemiología molecular de la infección por el virus DVB.