Análisis espacio-temporal de las redes de transmisión del subtipo B de VIH-1 en Uruguay

Abstract

El subtipo B del VIH-1 (VIH-1B) es el linaje mejor caracterizado de la pandemia de VIH. En las Américas, VIH-1B constituye la variante genética predominante y se encuentra representado por dos grupos genéticamente diferenciados: el clado pandémico (BPAN), responsable de la mayoría de las infecciones, y los clados caribeños parafiléticos (BCAR). En Uruguay, el subtipo B representa el 39,4% de los casos de VIH; sin embargo, la contribución relativa y la dinámica espacio-temporal de los clados pandémicos y no pandémicos permanecen insuficientemente caracterizadas. En este trabajo se analizaron un total de 491 secuencias del gen pol de VIH-1B y sus metadatos asociados, obtenidos a partir de la vigilancia nacional en Uruguay entre 2007 y 2021. Los análisis filogenéticos permitieron identificar secuencias pertenecientes a los clados BPAN y BCAR, así como reconstruir eventos de introducción y dispersión viral. El análisis filogeográfico se realizó mediante reconstrucción de estados ancestrales. La dinámica poblacional y epidemiológica de los principales clados uruguayos BPAN fue evaluada mediante los modelos Bayesian Skygrid y Birth–Death Skyline. Los resultados evidenciaron que la epidemia uruguaya de VIH-1B estuvo dominada por el clado BPAN (96,3%), con una contribución minoritaria de los clados BCAR (3,7%). Se identificaron 277 introducciones independientes de BPAN a Uruguay, cerca del 80% de ellas provenientes de Brasil. Dos grandes linajes específicos de Uruguay (BPAN–UY–I y BPAN–UY–II), emergidos entre mediados y finales de la década de 1980, representaron una proporción importante de las infecciones locales. Los análisis filodinámicos indicaron un crecimiento epidémico sostenido de BPAN–UY–I y BPAN–UY–II hasta aproximadamente 2005, seguido de una estabilización parcial (2005–2015) y una posterior disminución de la transmisión en los años más recientes. Cerca de la mitad de los eventos de transmisión inferidos para BPAN–UY–I y BPAN–UY–II ocurrieron dentro de los primeros dos años posteriores a la infección primaria. En conjunto, los resultados indican que la epidemia uruguaya de VIH-1B se caracteriza por frecuentes introducciones, pero con un establecimiento limitado de linajes, donde la expansión epidémica fue impulsada por un pequeño número de linajes pandémicos específicos del país. Los patrones filodinámicos indican una epidemia madura en transición desde una fase de expansión hacia una estabilización, seguida por una reciente disminución en la transmisión. La concentración de eventos de transmisión durante la infección temprana y la fuerte conectividad transfronteriza resaltan la necesidad de diagnóstico precoz y vigilancia molecular sostenida para interrumpir las redes activas de transmisión.