Caracterización y comparación de la dinámica de las secuencias repetidas en los genomas de tres especies de la familia Myrtaceae

Abstract

Las secuencias repetidas (repitoma) juegan un rol relevante en la evolución del genoma de las plantas. El estudio de su composición y dinámica es de sumo interés para la comprensión de procesos evolutivos tales como mecanismos de especiación. El estudio del repitoma en la familia Myrtaceae está escasamente desarrollado. Esta familia incluye especies de gran importancia económica, ya sea por sus aptitudes frutales, como es el caso de Psidium guajava y Feijoa sellowiana (tribu Myrteae), como por ser recursos de biomasa y celulosa, como es el caso de Eucalyptus grandis (tribu Eucalypteae). Actualmente, la herramienta RepeatExplorer® facilita la caracterización del repitoma en especies sin genomas de referencia, utilizando secuenciación de baja cobertura y análisis de clustering. Este trabajo propone obtener información de composición y abundancia de elementos transponibles y secuencias repetidas en tándem para cada especie estudiada, sumado a un estudio comparativo entre dos las dos tribus antes mencionadas. Los linajes de secuencias repetidas obtenidos coinciden en las tres especies con diferencias en sus abundancias. Es destacable que, en este trabajo, se genera el primer reporte de cuatro familias de ADN satélite para las mirtáceas. El estudio contribuye al conocimiento de la dinámica de los elementos transponibles en dos tribus de la familia Myrtaceae, y a la comprensión de eventos evolutivos en sus genomas.