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https://hdl.handle.net/20.500.12008/39931
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Campo DC | Valor | Lengua/Idioma |
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dc.contributor.author | Panzera Crespo, Yanina | - |
dc.contributor.author | Calleros Basilio, Lucía | - |
dc.contributor.author | Goñi Mazzitelli, Natalia | - |
dc.contributor.author | Marandino, Ana | - |
dc.contributor.author | Techera, Claudia | - |
dc.contributor.author | Grecco Patiño, Sofía | - |
dc.contributor.author | Ramos, Natalia | - |
dc.contributor.author | Frabasile Giurato, Sandra Alicia | - |
dc.contributor.author | Tomás Custodio, Gonzalo Martín | - |
dc.contributor.author | Condon Agustoni, Emma María | - |
dc.contributor.author | Cortinas, María Noel | - |
dc.contributor.author | Ramas, Vivivana | - |
dc.contributor.author | Coppola, Leticia | - |
dc.contributor.author | Sorhouet, Cecilia | - |
dc.contributor.author | Mogdasy, Cristina | - |
dc.contributor.author | Chiparelli, Héctor | - |
dc.contributor.author | Arbiza, Juan | - |
dc.contributor.author | Delfraro Vázquez, Adriana Beatriz | - |
dc.contributor.author | Pérez Crossa, Ruben Gustavo | - |
dc.date.accessioned | 2023-09-18T15:14:44Z | - |
dc.date.available | 2023-09-18T15:14:44Z | - |
dc.date.issued | 2022 | - |
dc.identifier.citation | Panzera Crespo, Y, Calleros Basilio, L, Goñi Mazzitelli, N, [y otros autores]. "Consecutive deletions in a unique Uruguayan SARS-CoV-2 lineage evidence the genetic variability potential of accessory genes". PLoS ONE. [en línea] 2022, 17(2): e0263563.12 h. DOI: 10.1371/journal.pone.0263563 | es |
dc.identifier.issn | 1932-6203 | - |
dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.12008/39931 | - |
dc.description.abstract | Deletions frequently occur in the six accessory genes of SARS-CoV-2, but most genomes with deletions are sporadic and have limited spreading capability. Here, we analyze deletions in the ORF7a of the N.7 lineage, a unique Uruguayan clade from the Brazilian B.1.1.33 lineage. Thirteen samples collected during the early SARS-CoV-2 wave in Uruguay had deletions in the ORF7a. Complete genomes were obtained by Illumina next-generation sequencing, and deletions were confirmed by Sanger sequencing and capillary electrophoresis. The N.7 lineage includes several individuals with a 12-nucleotide deletion that removes four amino acids of the ORF7a. Notably, four individuals underwent an additional 68-nucleotide novel deletion that locates 44 nucleotides downstream in the terminal region of the same ORF7a. The simultaneous occurrence of the 12 and 68-nucleotide deletions fuses the ORF7a and ORF7b, two contiguous accessory genes that encode transmem- brane proteins with immune-modulation activity. The fused ORF retains the signal peptide and the complete Ig-like fold of the 7a protein and the transmembrane domain of the 7b protein, suggesting that the fused protein plays similar functions to original proteins in a single format. Our findings evidence the remarkable dynamics of SARS-CoV-2 and the possibility that single and consecutive deletions occur in accessory genes and promote changes in the genomic organization that help the virus explore genetic variations and select for new, higher fit changes. | es |
dc.format.extent | 12 h. | es |
dc.format.mimetype | application/pdf | es |
dc.language.iso | en_US | es |
dc.publisher | Public Library of Science | es |
dc.relation.ispartof | PLoS ONE, 2022, 17(2): e0263563. | es |
dc.rights | Las obras depositadas en el Repositorio se rigen por la Ordenanza de los Derechos de la Propiedad Intelectual de la Universidad de la República.(Res. Nº 91 de C.D.C. de 8/III/1994 – D.O. 7/IV/1994) y por la Ordenanza del Repositorio Abierto de la Universidad de la República (Res. Nº 16 de C.D.C. de 07/10/2014) | es |
dc.subject | Covid 19 | es |
dc.subject | Sars Cov2 | es |
dc.subject | Genomics | es |
dc.subject | Viral evolution | es |
dc.title | Consecutive deletions in a unique Uruguayan SARS-CoV-2 lineage evidence the genetic variability potential of accessory genes | es |
dc.type | Artículo | es |
dc.contributor.filiacion | Panzera Crespo Yanina, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Biología. | - |
dc.contributor.filiacion | Calleros Basilio Lucía, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Biología. | - |
dc.contributor.filiacion | Goñi Mazzitelli Natalia, MSP | - |
dc.contributor.filiacion | Marandino Ana, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Biología. | - |
dc.contributor.filiacion | Techera Claudia, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Biología. | - |
dc.contributor.filiacion | Grecco Patiño Sofía, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Biología. | - |
dc.contributor.filiacion | Ramos Natalia, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Biología. | - |
dc.contributor.filiacion | Frabasile Giurato Sandra Alicia, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Biología. | - |
dc.contributor.filiacion | Tomás Custodio Gonzalo Martín, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Biología. | - |
dc.contributor.filiacion | Condon Agustoni Emma María, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Biología. | - |
dc.contributor.filiacion | Cortinas María Noel, MSP | - |
dc.contributor.filiacion | Ramas Vivivana, MSP | - |
dc.contributor.filiacion | Coppola Leticia, MSP | - |
dc.contributor.filiacion | Sorhouet Cecilia, Mutualista Médica Uruguaya. Montevideo, Uruguay | - |
dc.contributor.filiacion | Mogdasy Cristina, MSP | - |
dc.contributor.filiacion | Chiparelli Héctor, MSP | - |
dc.contributor.filiacion | Arbiza Juan, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Biología. | - |
dc.contributor.filiacion | Delfraro Vázquez Adriana Beatriz, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Biología. | - |
dc.contributor.filiacion | Pérez Crossa Ruben Gustavo, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Biología. | - |
dc.rights.licence | Licencia Creative Commons Atribución (CC - By 4.0) | es |
dc.identifier.doi | 10.1371/journal.pone.0263563 | - |
Aparece en las colecciones: | Publicaciones académicas y científicas - Facultad de Ciencias |
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