Desarrollo de herramienta para visualización y análisis de evolución de virus.

Abstract

El estudio de poblaciones de virus de ARN es una tarea desafiante dada su habilidad para evolucionar rápidamente y evadir la respuesta inmune del huésped, basada en la variabilidad genética extrema. El surgimiento de las tecnologías de NGS (Next Generation Sequencing) ha provocado que la adquisición de datos de evolución de poblaciones de virus a lo largo del tiempo sea factible. La dificultad recae en la cantidad y estructura de los datos. El análisis de datos evolutivos de virus es particularmente útil para medir la capacidad mutacional de los virus y su habilidad para adaptarse a nuevos ambientes. A partir del trabajo "Análisis y Visualización de la Evolución de Virus" [31] en este proyecto se desarrolla una herramienta para analizar y visualizar los datos obtenidos por experimentos evolutivos de distintas especies de virus de ARN, con el fin de poder entender los mecanismos que subyacen la adaptación de estos virus a distintos ambientes. Se desarrollaron dos nuevas aproximaciones metodológicas, una con una componente mas visual y otra más analítica. Como resultado se obtuvo una herramienta que integra todos estas aproximaciones brindando una interfaz al usuario. Se realizaron pruebas con un conjunto de datos conocidos, logrando obtener información de interés ya relevada.