Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem:
https://hdl.handle.net/20.500.12008/22078
Cómo citar
Registro completo de metadatos
Campo DC | Valor | Lengua/Idioma |
---|---|---|
dc.contributor.author | Castells Bauer, Matías | es |
dc.contributor.author | Victoria, Matías | es |
dc.contributor.author | Colina, Rodney | es |
dc.contributor.author | Musto, Héctor | es |
dc.contributor.author | Cristina, Juan | es |
dc.date.accessioned | 2019-10-02T22:14:45Z | - |
dc.date.available | 2019-10-02T22:14:45Z | - |
dc.date.issued | 2017 | es |
dc.date.submitted | 20191001 | es |
dc.identifier.citation | Castells, M., et al. Genome-wide analysis of codon usage bias in Bovine Coronavirus. Virology Journal, 2017, 14 (1), art. no. 115. doi: 10.1186/s12985-017-0780-y | es |
dc.identifier.issn | 1743-422X | es |
dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.12008/22078 | - |
dc.description.abstract | Background Bovine coronavirus (BCoV) belong to the genus Betacoronavirus of the family Coronaviridae. BCoV are widespread around the world and cause enteric or respiratory infections among cattle, leading to important economic losses to the beef and dairy industry worldwide. To study the relation of codon usage among viruses and their hosts is essential to understand host-pathogen interaction, evasion from host's immune system and evolution. Methods We performed a comprehensive analysis of codon usage and composition of BCoV. Results The global codon usage among BCoV strains is similar. Significant differences of codon preferences in BCoV genes in relation to codon usage of Bos taurus host genes were found. Most of the highly frequent codons are U-ending. G + C compositional constraint and dinucleotide composition also plays a role in the overall pattern of BCoV codon usage. Conclusions The results of these studies revealed that mutational bias is a leading force shaping codon usage in this virus. Additionally, relative dinucleotide frequencies, geographical distribution, and evolutionary processes also influenced the codon usage pattern. | es |
dc.format.mimetype | application/pdf | es |
dc.language.iso | en | es |
dc.publisher | BioMed Central Ltd. | es |
dc.relation.ispartof | Virology Journal, 2017, 14 (1), art. no. 115 | es |
dc.rights | Las obras depositadas en el Repositorio se rigen por la Ordenanza de los Derechos de la Propiedad Intelectual de la Universidad De La República. (Res. Nº 91 de C.D.C. de 8/III/1994 – D.O. 7/IV/1994) y por la Ordenanza del Repositorio Abierto de la Universidad de la República (Res. Nº 16 de C.D.C. de 07/10/2014) | es |
dc.subject | Bovine | es |
dc.subject | Codon usage | es |
dc.subject | Coronavirus | es |
dc.subject | Evolution | es |
dc.title | Genome-wide analysis of codon usage bias in Bovine Coronavirus | es |
dc.type | Artículo | es |
dc.contributor.filiacion | Castells, Matías. Universidad de la República (Uruguay). CENUR | es |
dc.contributor.filiacion | Victoria, Matías. Universidad de la República (Uruguay). CENUR | es |
dc.contributor.filiacion | Colina, Rodney. Universidad de la República (Uruguay). CENUR | es |
dc.contributor.filiacion | Musto Mancebo, Héctor Mario. Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Biología | es |
dc.contributor.filiacion | Cristina, Juan. Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Instituto de Investigaciones Nucleares | es |
dc.rights.licence | Licencia Creative Commons Atribución (CC –BY 4.0) | es |
dc.identifier.doi | 10.1186/s12985-017-0780-y | es |
Aparece en las colecciones: | Publicaciones académicas y científicas - Facultad de Ciencias |
Ficheros en este ítem:
Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | ||
---|---|---|---|---|---|
101186s129850170780y.pdf | 429,79 kB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |
Este ítem está sujeto a una licencia Creative Commons Licencia Creative Commons