https://hdl.handle.net/20.500.12008/3871 Reúne las tesis de Maestría y Doctorado 2026-09-17T16:51:12Z https://hdl.handle.net/20.500.12008/56647 Título: Gradiente nicho-neutral y variabilidad ambiental como determinantes de la relación diversidad-funcionamiento en comunidades vegetales de charcos temporales Autor: de León de León, Santiago Agustín Resumen: Los mecanismos que vinculan la biodiversidad con el funcionamiento ecosistémico (BEF) se atribuyen generalmente a la complementariedad de rasgos y a la selección de las especies mejor adaptadas. Sin embargo, la gran variación en la forma y magnitud de las relaciones BEF bajo condiciones naturales sugiere la existencia de factores aún no comprendidos. Dado que estos mecanismos dependen de la relación entre rasgos y desempeño de las especies, la variación en el rol de los rasgos durante el ensamblaje comunitario debería modular las relaciones BEF observadas. En un estudio de 19 años en metacomunidades de plantas de 61 charcos temporales, entre el 28 y el 89% de la variación en la ocurrencia de especies fue explicada por sus rasgos en disDntos años. Los cambios interanuales en las condiciones ambientales fortalecieron el ensamblaje mediado por rasgos, mientras que condiciones estables promovieron ensamblajes independientes de rasgos. La dependencia del funcionamiento ecosistémico respecto de la biodiversidad aumentó sistemáDcamente con el rol de los rasgos, parDcularmente en años con mayores precipitaciones, cuando un fuerte acople rasgo–ambiente favoreció la producción de biomasa. La diversidad fue mayor en los años con ensamblajes más estocásDcos, condiciones en las cuales el funcionamiento dependió menos de la biodiversidad, probablemente debido a la existencia de ensamblajes con menor acople organismo-ambiente y menor complementariedad funcional. La reducción del papel de los rasgos con la riqueza de especies, con el consecuente debilitamiento en la generación de biomasa y su dependencia de la biodiversidad, proporcionan una nueva explicación a la amplia gama de patrones observados en la naturaleza y parcialmente explicados por la teoría contemporánea. Estos resultados sustentan la importancia de incorporar los mecanismos de ensamblaje de comunidades para la comprensión de la interrelación entre biodiversidad y funcionamiento de los ecosistemas.; The mechanisms linking biodiversity to ecosystem functioning (BEF) are generally abributed to trait complementarity and the selection of beber-adapted species. However, the wide variation in the form and magnitude of BEF relationships under natural conditions suggests the existence of factors that remain poorly understood. Because these mechanisms depend on the relationship between species traits and performance, variation in the role of traits during community assembly should modulate observed BEF relationships. In a 19-year study of plant metacommunities across 61 temporary ponds, between 28% and 89% of the variation in species occurrence was explained by their traits across years. Interannual changes in environmental conditions strengthened trait-mediated assembly, whereas stable conditions promoted trait-independent assembly. The dependence of ecosystem functioning on biodiversity increased systematically with the role of traits, particularly in years with higher precipitation, when strong trait–environment coupling enhanced biomass production. Diversity was higher in years characterized by more stochastic assembly, conditions under which ecosystem functioning depended less on biodiversity, probably due to weaker organism–environment coupling and lower functional complementarity. The declining role of traits with increasing species richness, and the consequent weakening of biomass production and its dependence on biodiversity, provide a novel explanation for the wide range of paberns observed in nature that are only partially accounted for by contemporary theory. These results highlight the importance of incorporating community assembly mechanisms to understand the interplay between biodiversity and ecosystem functioning. 2026-01-01T00:00:00Z https://hdl.handle.net/20.500.12008/56646 Título: Generación y validación del primer genoma a nivel cromosómico del Bagre rayado Pseudoplatystoma magdaleniatum (Siluriformes, Pimelodidae) Autor: Almansa Villa, Diego Alejandro Resumen: La genómica de especies no modelo se ha visto impulsada en los últimos años por el desarrollo de nuevas tecnologías de secuenciación, en particular las plataformas de lectura larga y los enfoques que aportan información de largo alcance para la organización cromosómica. Este avance ha sido acompañado por el desarrollo de estrategias bioinformáticas para el ensamblaje y la anotación genómica. En este contexto, en el presente trabajo se generó y caracterizó el primer genoma completo a nivel cromosómico del bagre rayado Pseudoplatystoma magdaleniatum, un pez migratorio de gran importancia ecológica, socioeconómica y cultural en la cuenca Magdalena–Cauca en Colombia. Hasta la fecha, este es el ensamblaje más completo disponible para el género Pseudoplatystoma y la familia Pimelodidae. Para la construcción del genoma se evaluaron comparativamente varias estrategias de ensamblaje de novo basadas en lecturas cortas de Illumina y lecturas largas de Oxford Nanopore Technologies. A partir de métricas de contigüidad y completitud génica se seleccionó el ensamblaje óptimo, que fue posteriormente anclado, a nivel cromosómico, mediante la integración de datos Hi-C y refinado mediante corrección de errores con lecturas cortas. El ensamblaje final presenta un tamaño aproximado de 790 Mb, organizado mayoritariamente en 28 pseudocromosomas, con altos niveles de contigüidad (N50 > 28 Mb, L50 = 12) y completitud génica (96,4% de ortólogos BUSCO completos) y el cromosoma mitocondrial de 16.568 pb. El ensamblaje fue caracterizado a nivel estructural y funcional, incluyendo el análisis del contenido repetitivo, la anotación génica y la evaluación de su completitud. La predicción génica mediante BRAKER3 produjo 58.040 modelos de genes, de los cuales más del 80% presenta al menos una anotación funcional basada en ortología o en firmas de dominios proteicos. La coherencia y calidad del genoma obtenido fueron validadas mediante análisis filogenéticos mitocondriales y estudios de sintenia comparativa con otros Siluriformes, confirmando su consistencia estructural y su utilidad como genoma de referencia. El genoma de Pseudoplatystoma magdaleniatum generado en este trabajo constituye un recurso genómico de alta calidad para estudios evolutivos, comparativos y de conservación en Siluriformes, y representa un aporte significativo al conocimiento genómico de los peces neotropicales.; Genomics in non-model species has been greatly advanced in recent years by the development of new sequencing technologies, particularly long-read platforms and approaches that provide long-range information for chromosome-scale genome organization. These technological advances have been accompanied by the refinement of bioinformatic strategies focused on key processes such as genome assembly and annotation. In this context, the present study generated and characterized the first chromosome level genome assembly for the striped catfish Pseudoplatystoma magdaleniatum, a migratory species of major ecological, socioeconomic, and cultural importance in the Magdalena–Cauca basin in Colombia. To our knowledge, this represents the most complete genome assembly currently available for the genus Pseudoplatystoma and the family Pimelodidae. Multiple de novo assembly strategies based on Illumina short reads and Oxford Nanopore Technologies long reads were comparatively evaluated. Based on contiguity and gene completeness metrics, the optimal assembly was selected and subsequently scaffolded to chromosome scale by integrating Hi-C data, followed by short-read–based error correction. The final assembly has a total size of ~790 Mb and is largely organized into 28 pseudochromosomes, with high contiguity (N50 > 28 Mb, L50 = 12) and gene completeness (96.4% complete BUSCO orthologs), and includes the complete mitochondrial genome of 16,568 bp. The assembly was structurally and functionally characterized, including analyses of repetitive elements, gene annotation, and completeness assessment. Gene prediction with BRAKER3 yielded 58.040 gene models, of which more than 80% have at least one functional annotation based on orthology or conserved protein domains. Genome consistency and quality were further validated through mitochondrial phylogenetic analyses and comparative synteny with other Siluriformes genomes, confirming its structural coherence and reliability as a reference genome. Overall, the Pseudoplatystoma magdaleniatum genome generated in this work constitutes a high-quality genomic resource for evolutionary, comparative, and conservation studies within Siluriformes, and represents a significant contribution to the genomic knowledge of Neotropical fishes. 2026-01-01T00:00:00Z https://hdl.handle.net/20.500.12008/56639 Título: Problema de Plateau asintótico en el espacio hiperbólico Autor: Martínez Leiranes, Marcos Resumen: El problema de Plateau asintótico en el espacio hiperbólico nos dice que, para toda curva de Jordan orientada C en S^2 y todo número κ entre 0 y 1, existe un único disco orientado D en H^3 de curvatura extrínseca κ que tiene a C como su borde asintótico. Este resultado fue probado por Rosenberg–Spruck en [RS94] para H3 y extendido por Labourie a variedades de curvatura negativa en [Lab00]. Esta tesis, presenta una demostración alternativa a este resultado, construyendo D como el conjunto convexo obtenido minimizando el volumen asintótico dentro de la familia de convexos cuyo borde tiene curvatura mayor o igual que κ, en sentido un débil. Posteriormente, se demuestra la regularidad para el caso C^2, a partir de un argumento elemental de geometría hiperbólica. Demostrando tanto la unicidad como la regularidad para una curva de Jordan arbitraria, a partir de un Teorema de Precompacidad demostrado por Labourie en [Lab97]. Descripción: Tribunal: Juan Pablo Borthagaray, Miguel Paternain y Martín Reiris 2026-01-01T00:00:00Z https://hdl.handle.net/20.500.12008/56632 Título: Estudio de los dientes de terópodos (Dinosauria, Saurichia) de la formación Tacuarembó (Jurásico Tardío-Cretácico Temprano), Uruguay Autor: Soto, Matías Resumen: Los dientes de dinosaurios terópodos son fósiles muy comunes en depósitos continentales mesozoicos en todo el mundo. Muchas veces son los elementos predominantes, o incluso los únicos, en una localidad fosilífera. Lamentablemente, con escasas excepciones recientes no se ha adoptado un método riguroso, basado en análisis multivariados, para identificar los taxones que los produjeron. Una correcta identificación de los mismos sería relevante por sus diversas implicancias: bioestratigráficas, paleobiogeográficas y paleoecológicas. En el caso de Uruguay, desde hace más de una década se están recobrando dientes aislados de terópodos de las areniscas de la Formación Tacuarembó. Los objetivos del presente trabajo son determinar con que dientes de terópodos ya conocidos ostentan una mayor similitud morfológica, y deterrminar cuantos taxones diferentes estarían representados en la Formación Tacuarembó. Primeramente se realiza una revisión de los caracteres que permiten identificar y diferenciar entre si las coronas dentarias de los distintos taxones de terópodos, así como una síntesis de las faunas de terópodos del Jurásico de Gondwana. Posteriormente, se describen los diferentes morfotipos representados en el material uruguayo, siendo asignados a Ceratosauridae, Abelisauroidea y Carnosauria (e.g. Carcharodontosauridae). Algunos dientes pertenecen a pequefios terópodos de afinidades inciertas. Se midieron o calcularon once variables: AL (apical lenght), CBL (crown base lenght), CBW (crown base width), CH (crown height), DAVG (distal average denticle density), CBR (crown base ratio), CHR (crown height ratio), CHR' (crown height ratio '), CMA (crown mesial angle), CAA (crown apical angle) y CDA (crown distal angle). Por último, se realizan análisis multivariados, incluyendo: Análisis de Componentes Principales (ACP), Análisis Discriminante (AD), Análisis Canónico de Poblaciones (ACPo) y Análisis de Agrupamiento de K-medias (AAK). En estos análisis se emplearon 32 dientes de Uruguay, los más completos, y solo 8 variables. En el ACP se obtuvo que las dos primeras componentes principales (CP) explican mas del 80% de la varianza total. Las variables que más aportan en sentido positivo son AL, CBL, CBW y CH (estando fuertemente correlacionadas con la CP1) y CMA y CAA (fuertemente correlacionadas con la CP2), mientras que las variables que más aportan en sentido negativo son DAVG y CDA (estando fuertemente correlacionadas con la CP1 y la CP2, respectivamente). Se separan claramente los dientes de pequeños terópodos de los de los grandes terópodos, solapándose con ambos los materiales uruguayos. En el AD se procedió en primer Iugar con las variables originales, y en segundo Iugar removiéndose el efecto alométrico en todas ellas (lo que es inédito en estudios de dientes de terópodos). Los principales resultados del AD no variaron con el tipo de variable empleada. Más de un 40% de los dientes de Uruguay son clasificados como Carnosauria (Allosauridae y Carcharodontosauridae), y más de un 30% como Abelisauroidea (Abelisauridae y Noasauridae). Los restantes dientes son asignados, en proporciones bajas, a distintos taxones (Ceratosauridae, Dromaeosauridae, Spinosauridae, Tyrannosauridae, Coelophysidae ). En el ACPo los dos primeros ejes canónicos explican más del 90% de Ia varianza total. Las variables que más aportan en sentido positivo son CBL, CBW y AL (estando fuertemente correlacionadas con el eje 1) y DAVG (fuertemente correlacionada con el eje 2), mientras que la variable que más aporta en sentido negativo es DAVG (estando fuertemente correlacionada con el eje 1). El AAK mostró solo una coincidencia parcial entre los clusters de dientes de Tacuarembó y los morfotipos reconocidos par criterios morfológicos. Se discuten las implicancias de estos resultados. La presencia de Ceratosauridae y Allosauridae, como en otras faunas del Jurásico Tardío de EE.UU. (Formación Morrison) y Portugal (Grupo Lourinha), podría explicarse por una distribución pangeica de dicho taxones. En cambio, Abelisauroidea y Carcharodontosauridae son taxones de distribución predominantemente gondwánica; en base a estos, las mayores similitudes se observan con la fauna del Jurásico Tardío de Tanzania (Formación Tendaguru). No obstante, es imperativo aumentar el tamaño de la muestra de Uruguay (a través de nuevos materiales), así como incluir más datos de terópodos jurásicos y/o gondwánicos, para confirmar o no las tendencias que surgen de estos análisis.; Theropod dinosaur teeth are very common fossils in Mesozoic continental deposits worldwide. Often they are the predominant elements, and even the single ones, in a fossil site. Unfortunately, a rigurous method (based in multivariate analysis) to identify the taxa which yielded them bas not been widely adopted, with few recent exceptions. A correct identification of the taxa would be relevant due to the biostratigraphic, paleobiogeographic and paleoecologic implications. In the case of Uruguay, theropod shed teeth have been being recovered from the Tacuarembó Formation sandstones since more than a decade. The objective of this dissertation is to stablish which known theropod teeth are the most similar to the ones found in the this unit, and how many taxa would have been represented. In first place, a careful review of the useful characters for identifying tooth crowns of different theropod taxa was made, and also a summary of the Late Jurassic theropod faunas (with emphasis in Gondwana) was performed. In second place, different morphotypes are recognized among the Uruguayan materials, being assigned to the Ceratosauridae, Abelisauroidea and Carnosauria (e.g. Carcharodontosauridae). A few teeth belong to siezed small therpods of uncertain affinities. Eleven variables were measured or calculated: AL (apicallenght), CBL (crown base lenght), CBW (crown base width), CH (crown height), DAVG (distal average denticle density), CBR (crown base ratio), CHR (crown height ratio), CHR' (crown height ratio '), CMA (crown mesial angle), CAA (crown apical angle), and CDA (crown distal angle). Finally, several multivariate analyses were performed, including Principal Component Analysis (ACP), Discriminant Analysis (AD), Canonical Variate Analysis (ACPo) and K-means Cluster Analysis (AAK). In these analysis 32 teeth from Uruguay (the most complete ones) and 8 variables were used. In the ACP the two first principal components.(CP) explain more than 80% of the total variance. The main variables with positive loads are AL, CBL, CBW and CH (being strongly correlated with the CPl) and CMA and CAA (being strongly correlated with the CP2), while the main variables with negative loads are DAVG and CDA (being strongly correlated with the CPl and CP2, respectively). Teeth from small and large sized theropods clearly separate from each other, the Uruguayan material partly overlapping both groups. In the AD two runs were performed: the first one with the original variables and the second one with the variables with the allometric effect removed (the latter being unprecedented in studies concerning theropod teeth). The main results did not vary with one or another set of variables. More than 40% of the Uruguayan teeth were classified as Carnosauria (Allosauridae and Carcharodontosauridae), and more than 30% as Abelisauroidea (Abelisauridae and Noasauridae). The remaining teeth were classified, in low percentages, to different taxa (Ceratosauridae, Dromaeosauridae, Spinosauridae, Tyrannosauridae, Coelophysidae ). In the ACPo the two first canonical axes explain more than 90% of the total variance. The variables with more positive loads are CBL, CBW and AL (being strongly correlated with the first axe) and DAVG (strongly correlated with the second axe). In turn, the main variable with negative loads is DAVG (strongly correlated with the first axe). The AAK showed only a partial agreement among the clusters ofUruguayan materials and the morphotypes recognized by morphological criteria. The implications of these results are discussed. The presence of ceratosaurid and allosaurid therpods, as in others Late Jurassic faunas of USA (Morrison Formation) and Portugal (Lourinha Group), can be explained invoking a Pangean distribution of these taxa. However, abelisauroid and carcharodontosaurid theropods are predominantly Gondwanan taxa; their presence suggest that the greatest similarity is with the Late Jurassic fauna of Tanzania (Tendaguru Formation). The. Uruguayan sample size (with new materials) must be increased, and more data from Jurassic and/or Gondwanan taxa must be included, in order to confirm or discard the tendences resulted from these analyses. 2010-01-01T00:00:00Z