Carreras:
Licenciatura en Bioquímica
Licenciatura en Ciencias Biológicas
Licenciatura en Ciencias Biológicas
Código de la carrera:
302
137
137
Tipo de la carrera:
Grado
Unidad Curricular (Programa):
Programa de Transcriptómica 1: RNA-seq
Denominación variante en otra Licenciatura :
Código del programa:
BG991_2023
Año desde que se dicta:
2023
Año de publicación:
2023
Código del plan:
1083
1110
1110
Código de unidad curricular (curso):
BG991
Resumen:
El curso propone brindar al estudiante el entendimiento de los conceptos principales y de las aplicaciones de la transcriptómica. Los conceptos incluyen: uso de diferentes tecnologías de secuenciación y sus ventajas; aplicaciones; selección de muestras y replicación; pre-procesamiento de datos y control de calidad; métodos de ensamblado transcriptómico; análisis de expresión diferencial entre condiciones o grupos; interpretación de los resultados con respecto al rol de los genes en procesos y vías metabólicas; introducción al análisis de expresión génica a nivel de células únicas. Las herramientas incluyen: las de alineamiento y ensamblado (e.g. STAR, HISAT2, StringTie, Kallisto, Trinity, featureCounts); las de control de calidad y pre-procesamiento (e.g. FastQC, MultiQC, Trimmomatic, Cutadapt); las de expresión diferencial (e.g. DESeq2, edgeR, limma, sleuth); las de anotación funcional (e.g. clusterProfiler, GOSeq); las que contribuyen a la visualización de los resultados (e.g. IGV y paquetes de R/Bioconductor múltiples). El estudiante adquirirá habilidades que le permitirán: - diseñar un
experimento de RNA-seq con controles y replicación apropiados - analizar un experimento de RNA-seq, incluyendo efectuar controles de calidad, expresión diferencial e interpretación funcional. - visualizar datos transcriptómicos a través de diferentes tipos de gráficos y comunicar efectivamente sus resultados - pensamiento crítico: desarrollar la capacidad de evaluar e interpretar resultados transcriptómicos, así como hacer frente a problemas que puedan surgir.
Notas:
Responsable:
Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Comisión de Carrera Bioquímica
Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Comisión de Carrera Ciencias Biológicas
Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Comisión de Carrera Ciencias Biológicas
Idioma:
es
Licencia:
Licencia Creative Commons Atribución - No Comercial - Sin Derivadas (CC - By-NC-ND 4.0)
Tipo de documento:
Programa
Formato:
application/pdf
Cita:
Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Ciencias. Comisión de Carrera Bioquímica, Ciencias Biológicas. Programa de Transcriptómica 1: RNA-seq [en linea] 2023. Plan 2017, Plan 2017.
metadata.unidadCurricularProgramas.dc.coverage.spatial:
metadata.unidadCurricularProgramas.dc.coverage.temporal:
Colecciones:
| Ficheros | Descripción | Tamaño | Formato | ||
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| BG991_2023.pdf | — | 94.64 KB | Adobe PDF |